• Ders Başlangıç Tarihi

    15 Nisandan itibaren İstediğiniz zaman

  • Format

    Eş zamansız (asenkron) Modül

    NCBI, ENSEMBL ve UCSC Genom Tarayıcıları Uygulamalı Eğitimi

    Genomun Dijital Haritasında Ustalaşın: NCBI, Ensembl ve UCSC Veri Madenciliği

    Veri yığınları arasında kaybolmayı bırakın, hedef odaklı analize başlayın. Dünyanın en büyük üç genomik platformunu kullanarak genetik veriyi bulma, görselleştirme ve yorumlama becerilerinizi uluslararası standartlara taşıyın.

    NCBI veritabanları, Ensembl ve UCSC Genome Browser gibi genom tarayıcıları, araştırmacılara ve bioinformatikçilere genetik veri analizi konusunda güçlü araçlar sunar. NCBI ve genom tarayıcıları eğitimi, genetik veri analizindeki kilit özellikleri, pratik uygulamaları ve güncel eğilimleri hızlı ve pratik olarak öğrenmeniz için tasarlanmıştır.
    • Mevcut katılımcılar

      72+

    • Kontenjan:

      SON 78 kontenjan

      Süre: 

      8 Saatlik video ders,
      Bölüm sonu sınavları, 
      Okumalar

      Write your awesome label here.
      — Yeni dönem

      "Genomic Data Hunter"

      Çoğu araştırmacı için bir genin exon yapısını incelemek veya bir varyantın genomik konumunu bulmak saatler süren bir "arama" sürecine dönüşür. Oysa NCBI, Ensembl ve UCSC Genome Browser; doğru kullanıldığında size sadece veri sunmaz, verinin hikayesini anlatır.

      Bu eğitimde; genetik verinin ana kaynaklarına "misafir" olarak değil, "ev sahibi" olarak girmeyi öğreneceksiniz. Bir genin farklı bölgelerini UCSC'de keşfetmeyi, Ensembl ile analizler yapmayı ve NCBI veritabanlarından en optimize veriyi çekmeyi başarıp; araştırmalarınızdaki hızın ve yayın kalitenizin nasıl arttığını bizzat deneyimleyeceksiniz.

      Bunları biliyor musunuz?

      Genom da "Power User" Olmak

      Genom tarayıcılarını sadece bir arama motoru gibi kullanmak, araştırmacıların en büyük zaman kaybıdır. İleri düzey araçlar, binlerce genin verisini saniyeler içinde toplu halde çekmenizi sağlar.
      Kasprzyk, A. (2011). "BioMart: driving a paradigm change in biological data management." Database (Oxford).

      Görsel Kanıt ve Şeffaflık

      Artık sadece "X geni regüle oldu" demek yetmiyor. Dergiler, genin bulunduğu genomik bağlamı (genomic context), epigenetik işaretleri ve diğer "track"leri içeren görsel kanıtlar bekliyor.

      Gen-Fenotip İlişkisini Raporlamak

      Biyoteknoloji ve hassas tıp (personalized medicine) sektöründe, bu veritabanları sektör ve akademi  kritiktir ve veri entegrasyonu becerisi biyoteknoloji AR-GE süreçlerinde merkezi rol oynar.
      Cunningham, F., et al. (2022). "Ensembl 2022." Nucleic Acids Research.

      Kimler için uygun

      Lisans/Lisansüstü Öğrenciler

      Akademik kariyerinin başında olan ya da tez dönemindeki öğrencilerden tezlerinde ya da  projelerinde genomik veriye ihtiyaç duyan ve analizlerini uluslararası standartlarda yapmak isteyenler.

      Akademik ya da Sektörel Araştırmacılar

      Yayın kalitesini artırmak, projelerini hızlandırmak ve veritabanı kullanımında uzmanlaşmak isteyen araştırmacılar.

      Tıp ve Eczacılık Profesyonelleri

      Hastalık-gen ilişkisini, varyantların klinik önemini ve genetik veri kaynaklarını profesyonelce yorumlamak isteyen uzmanlar.

      Ne Kazanacaksınız?

      Karşılaştırmalı Genomik Tarayıcı Hakimiyeti (Ensembl vs. UCSC):  

      ki dev tarayıcı arasındaki arayüz farklarını aşarak, verinizi bir platformdan diğerine koordinat hatası yapmadan aktarma (Liftover) becerisi kazanacaksınız.
      ileri Düzey Veri Madenciliği ve Filtreleme: 

      Sadece arama kutusuna gen ismi yazmanın ötesine geçeceksiniz. 

      NCBI Gen ve Nükleotid veritabanlarında binlerce sonuç arasından RefSeq (Referans Dizi) ayrımı yapmayı ve sadece en güvenilir veriyi çekmeyi öğreneceksiniz.
      Ağ Oluşturma ve Kariyer Yönetimi: 

      Eğitimi alan diğer akademisyenler, doktora sonrası araştırmacılar ve sektör profesyonelleriyle etkileşim kurarak; ortak projeler, makale iş birlikleri ve kariyer fırsatları için zemin oluşturun.

      Yaşam Bilimleri Yetenek Ekosistemi'nin bir parçası olun.
      Gelecek Öngörüsü:  

      Genom veri analizi alanındaki teknolojik trendleri kavrayarak araştırmalarınızı modernize etme beceriniz artacak.

      En yeni araçları hızlıca öğrenip araştırmalarınıza uygulama deneyimi kazanacaksınız. 

      Neden Bu Eğitime Katılmalısınız?

      NCBI, Ensembl ve UCSC'de uzmanlaşmak sadece bir "araç" öğrenmek değil, araştırmalarınızda rehbersiz kalmamaktır.

      Akademik Standart ve Özgürlük

      Bu eğitimle, veritabanlarını "yüzeyden" değil, "derinden" kullanmayı öğreneceksiniz. toplu veri madenciliği yapma veya UCSC Track’leri ile figürler oluşturma yetkinliği, yayınlarınızın standartlara uyumunu ve kabul şansını doğrudan artırır.

      Bilimsel yayınlarınızda ve tezlerinizde "Veri şu kaynaktan alındı" demek yerine verinin hangi genom versiyonuyla (GRCh38 vb.) çekildiğini ve hangi parametrelerle analiz edildiğini yazarsınız.

      Kendi Hızınızda İlerleyin (%100 Esnek Öğrenme)

      Akademik hayatın mesai saati olmadığını; deneylerin, hastane nöbetlerinin veya ders yüklerinin planları nasıl altüst ettiğini biliyoruz. Bu yüzden eğitimi %100 asenkron (offline) olarak tasarladık.

      Canlı derslere yetişme stresi yok. İster  laboratuvarda, ister hafta sonu evinizde; dersleri istediğiniz zaman durdurup, kendi hızınızda ilerleyebilirsiniz.

      Dijital Ekosistem ve Doğrulanabilir Sertifikalar

      Sadece bir video izleyip geçmiyorsunuz; yaşam bilimleri alanındaki profesyonelleri bir araya getiren dinamik bir yetenek ekosistemine giriş yapıyorsunuz.

      Sertifikanız size özel ID ve doğrulanabilir dijital bağlantısı sayesinde LinkedIn ve CV’nizde şeffaf bir uzmanlık kanıtı sunar. Hem akademik mülakatlarda hem de biyoteknoloji sektöründeki iş başvurularında sizi "veri okuryazarı bir uzman" olarak bir adım öne çıkarır.

      Eğitim Deneyimi ve Metodoloji

      Dersler eş zamansız (asenkron) kendi hızında öğren programı olarak ilerleyecektir. Derslerdeki sorularınızı eğitmenlerimiz değerlendirecek ve buna göre ilerlemeniz takip edilecektir. 

      Adım Adım Yönergelerle Kendi Hızında Öğren

      Buraya tıklayın, şu veriyi seçin" şeklinde ilerleyen, karmaşadan uzak uygulamalı dersler.

      1 yıl boyunca  erişebileceğiniz videolarla, CV'nizi ve profilinizi adım adım, her akşam bir modülü tamamlayarak güncelleyin.

      Testler ve sorular

      Testler ve ödevlerle öğrendiklerinizi uygulayın. 

      Uygulamalarınızı ve sorularınızı Forumda paylaşın eğitmenler ve diğer katılımcılarla sonuçlarınızı tartışın. 

      Etkileşimli Topluluk

      Eres Biotech mezunlar ağında yer alan kıdemli uzmanlarla network kurma ve fırsatlardan ilk haberdar olma ayrıcalığı kazanın. 

      Mentörler, eğitmenler ve mezunların tecrübelerinden faydalanın. 
      Kişiye özel bağlantı ve ID numaralı dijital sertifikalar

      Başarınızı Belgelendirin

      Başarı Sertifikası

      Dersleri ve testleri tamamladığınızda anında sertifikanızı alabilirsiniz.

      Katılım Sertifikası

      Dersleri tamamlayın ve sertifikanızı hemen alın. 

      Kayıt Seçenekleri & Avantajlar:

      Unutmayın: Akademik takviminize göre değil, kendi hızınıza göre uzmanlaşın.
      Hemen kaydolun, dilediğiniz zaman başlayın.

      Öğrenci Planı

      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentörlük oturumları*
      Kaydol
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺4,100
      Kaydol
      Learning programs
      Öğrenci (1 Kurslar)
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺2,583
      Kaydol

      Profesyonel Planı

      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentörlük oturumları*
      Kaydol
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺4,100
      Kaydol
      Learning programs
      Öğrenci (1 Kurslar)
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺2,583
      Kaydol
       Planınızı seçmek için plana ait seçenekten kaydolunuz. 
      * Mentorlük çalışmaları birebir olarak gerçekleştirilecektir. Bunu için eğitmenler ve öğrenciler karşılıklı randevu oluşturacaktır. 

      Sık Sorulan Sorular

      Biyoinformatiğe tamamen yabancıyım, bu eğitim benim için çok mu ağır?

      Aksine, bu eğitim biyoinformatik dünyasına giriş yapmak için en doğru ve "güvenli" kapıdır. Karmaşık kodlama dillerinden önce, verinin mutfağını (NCBI, Ensembl, UCSC) öğrenmek size sağlam bir temel kazandırır. Bu dersi başarıyla tamamlayan her katılımcı, ileri seviye analizlere geçiş yapmak için gerekli özgüveni kazanmış olur.

      Eğitim asenkron (offline) olduğu için motivasyonumu kaybeder miyim?

      Eğitim modelimiz sadece "video izle ve geç" üzerine kurulu değildir. Her modül sonunda yer alan etkileşimli testler ve gerçek veritabanı simülasyonları sayesinde aktif öğrenme sürecinde kalırsınız. Kendi hızınızda ilerlerken, sanki yanınızda bir mentor varmışçasına pratik odaklı bir deneyim yaşarsınız.

      Eğitimde gösterilen araçlar güncel mi? Veritabanları çok hızlı değişiyor.

      En hassas olduğumuz nokta bu. NCBI, Ensembl ve UCSC sürekli güncellenen yapılar olduğu için eğitim içeriğimiz, bu platformların en güncel arayüzleri ve fonksiyonları (Örn: GRCh38/hg38 genom montajı güncellemeleri) dikkate alınarak hazırlanmıştır. "Eski" bilgilerle değil, bugünün laboratuvar standartlarıyla öğrenirsiniz.

      Daha önce "Biyoinformatiğe Giriş" eğitimi almadım, doğrudan buradan başlayabilir miyim?

      Bu eğitim temel seviyede olduğu için doğrudan katılabilirsiniz. Ancak genetik veri dünyasında çok daha hızlı bir adaptasyon ve "büyük resmi" görmek isterseniz, bu eğitimi tamamladıktan sonra veya eş zamanlı olarak Biyoinformatiğe Giriş modülümüzü de listenize eklemenizi akademik olarak tavsiye ederiz.

      Ödevler ve uygulamalar için ek bir ücretli yazılıma ihtiyacım olacak mı?

      Hayır. Eğitimde kullandığımız tüm tarayıcılar ve veritabanları (NCBI, Ensembl, UCSC) dünya çapındaki araştırmacıların kullanımına açık, ücretsiz ve web tabanlı platformlardır. İnternet erişimi olan her bilgisayar, sizin için profesyonel bir biyoinformatik istasyonuna dönüşecektir.

      8. Dönem Toplam Katılımcı İstatistikleri

      Pek çok araştırmacı, öğrenci ve profesyonel aramıza katıldı. Siz de yerinizi ayırtın. 
      Öğrenci kodu: OGRECI
      Çalışan kodu: CALISAN
      Video ders kodu: VIDEO

      Katılımcı

      Sertifika

      Saat
      — Kendi Hızınızda Öğrenin

      Rahat olduğunuz yerden katılın

      Online ve eş zamansız olan bu eğitime istediğiniz zaman, istediğiniz yerden, istediğiniz süre  katılabilirsiniz.

      Video Kayıtlarıyla Ders Kaçırmayın

       Dersleri kaçırma kaygınız olmaz. Ayrıca istediğiniz zaman istediğiniz dersi tekrar izleyebilirsiniz. 

      Ödevler ve Testler

      Eğitim içinde verimliliğinizi arttırmak ve sizi teşvik etmek için ödevler ve testler yer almaktadır. 

      Katılım Sertifikası

      Derslere katılan, test ve ödevleri tamamlayan katılımcılarımıza eğitimin ardından tekil id kodlu ve özel bağlantılı  katılım sertifikaları sağlanmaktadır. 

      Kariyer Mentörlüğü

      Bu ders katılımcıları için, birebir gerçekleştirilen 2 online oturumluk kariyer, yapay zeka kullanımı ve performans mentörlüğü sağlanır. 
      Write your awesome label here.
      Hastane rutininde online canlı derslere katılamıyordum. Bu yüzden eski dönemlere kayıt olmamıştım. Bu dersi ise boş vakitlerimde tabletimden kolayca takip edip uyguladım. Geri kalacağım korkusunu da kolayca aştım. Teşekkürler. 
      — Yakup P., Tıp Doktoru
      Tez döneminde veri toplama aşamasında artık herşey bir eyre dağılmış vaziyetteydi. Şimdi öğrendiğim tekniklerle veri setimi hem güncelledim hem de düzgünce organize ettim. Hoca verilerimi sorunca artık paniklemiyorum. 
      — Şayeste K., Biyomühendislik Yüksek Lisans Öğrencisi
      Özgeçmişime bildiğim konulara "NCBI" yazmak biraz basit kaçıyordu. Zaten ben de bu kadar detayına hakim değildim. Ama şimdi Genomik veri Madenciliği olarak yeni bir yetkinlik kazandığımı düşünüyorum. KAriyerimde fark ayratacağına inanıyorum. 
      Çağlar Y., Biyolog

      Genomun Haritasını Çözmek İçin Beklemeyin, Bugün Başlayın!

      Biyoinformatik araçları her geçen gün güncelleniyor, veritabanları büyüyor ve akademik rekabet keskinleşiyor. Araştırmalarınızda "kullanıcı" seviyesinden "uzman" seviyesine geçmek için ihtiyacınız olan her şey bu eğitimde sizi bekliyor.

      Deneyleriniz devam ederken, dersler yoğunlaşmışken, nöbet aralarınızda veya en verimli olduğunuz saatlerde; kendi hızınızda uzmanlaşın.
      Unutmayın: Size özel kayıt kodunuzu ödeme aşamasında kullanabilirsiniz.

      Tam paket profesyonel kayıt kodu: CALISAN 

      Tam paket öğrenci kayıt kodu: OGRENCI
      Video ders kayıt kodu: VIDEO
      Kursun asenkron olması kurtarıcı oldu. İstediğim zaman durdurup veritabanında deneme yapabildim, takıldığımda geri sardım. Harika bir sistem.
      ⭐⭐⭐⭐⭐

      Zeynep E., Tıp Doktoru

      Write your awesome label here.

      Ders Konuları

      Genomik Anotasyonlarda "Tekil Referans" Paradigması

      Genomik veri analizlerinde karşılaşılan en kritik metodolojik zorluk, aynı gen lokusu için farklı veritabanları tarafından tanımlanan alternatif transkript izoformlarıdır. NCBI (RefSeq) ve Ensembl (GENCODE), tarihsel olarak farklı anotasyon stratejileri kullanmıştır. Bu durum; ekzon sınırlarında ve protein uzunluklarında farklılıklara yol açarak araştırmacılar arasında koordinat uyumsuzlukları ortaya çıkarabilmektedir.

      Metodolojik standardizasyon ve analizlerin tekrarlanabilirliğini (reproducibility) artırmak amacıyla, MANE (Matched Annotation from NCBI and Ensembl) projesi kapsamındaki transkriptlerin kullanılması önerilmektedir.

      MANE Select, her gen için tek bir temsilci transkript tanımlar ve RefSeq ile Ensembl arasında %100 dizisel eşleşme (mRNA ve Protein) sağlar. Bu referansı kullanmak, metodolojinizin uluslararası anotasyon konsensüsü ile uyumlu olduğunu gösterir ve varyant yorumlamasında yüksek düzeyde karşılaştırılabilirlik sağlar.
      *Morales, J., et al. (2022). "A standardized set of human molecular biological methods (MANE)." Nature.

      Kariyer Sıçraması İçin Ücretsiz Rehberinizi Alın!

      E-posta listemize katılın, yapay zeka (ATS) sistemlerinden %90+ başarıyla geçen 'ATS Uyumlu Bilimsel CV Hazırlama Rehberi' anında e-postanıza gelsin. Sektörel ipuçlarını ve indirimleri kaçırmayın!
      Thank you!
      *E-posta adresimi bırakarak KVKK Aydınlatma Metni, Gizlilik Politikası ve Çerez Politikası şartlarını okuduğumu ve kabul ettiğimi beyan ederim.
      Write your awesome label here.
      ile oluşturuldu