Skip to content Skip to footer

Uygulamalı Biyoinformatiğe Giriş ve Yeni Nesil Dizi Analizi

649.00

29 – 30 EKİM 2022

Kimler Katılabilir: 

Kodlama bilgisi gerekmemektedir.

Katılmak için bilgisayarınız ve internet erişiminiz olması yeterlidir.

Öğrenciler için indirim kodu: NGS

 

Stokta yok

Bunu İstiyorum
Bunu İstiyorum
Kategoriler: Etiketler: , Product ID: 2311

Açıklama

UYGULAMALI BİYOİNFORMATİĞE GİRİŞ VE YENİ NESİL DİZİ ANALİZİ

Eğitim Tarihi : 29 – 30 Ekim 2022

Eğitim Saati : 10:00-17:00 , çevrim içi

Eğitim Adresi: Eğitimden önceki hafta Google Classroom davetiyeleri iletilecektir.

Eğitim Konuları:

  • Biyoinformatiğin kısa tarihi ve biyolojik temelleri
  • Birincil ve ikincil biyolojik veri tabanları
  • Genotip ve fenotip veri tabanları
  • NGS tasarımı ve platformlar
  • NGS iş akışı
  • Kalite kontrol analizi ve dosya formatları
  • Genom birleştirme (de novo vs yeniden dizileme)
  • Galaxy web server ana sayfa tanıtımı, NCBI GEO yükleme
  • Transkriptomik ve RNA-Seq
  • FastP ile kalite kontrol analizi
  • HISAT2 ile hizalama
  • Hizalama verilerinin IGV ile görüntülenmesi ve analizi
  • RSeqC araçları- Infer Strandedness, Read Distribution
  • Gene Body Coverage ile 5’/3′ bias belirleme
  • MarkDuplicates ve idxstats
  • featureCounts ile okuma sayımı
  • DESeq2 ile farklı ifade edilen genlerin belirlenmesi
  • Farklı ifade edilen genlerin anotasyonu ve görselleştirilmesi
  • STRING-DB ile işlevsel zenginleştirme (functional enrichment) analizi

 

 

 

 

 

Go To Top