Skip to content Skip to footer

Linux ve R Uygulamalarıyla RNA-seq Veri Analizi Eğitimi

7,250.00

3 – 14 Haziran/ Hafta içi 20:00 – 23:30/ Toplam 24 Saat/  Canlı – Online
Taksitli Kayıt için: https://iyzi.link/AJmcbQ 

Bunu İstiyorum
Bunu İstiyorum
Kategoriler: , , Etiketler: , , , Product ID: 3130

Açıklama

Linux ve R Uygulamalarıyla ile RNA-seq Veri Analizi Eğitimi

3-14 Haziran

Hafta içi 20:00 – 23:30

Canlı – Online

Kısıtlı Kontenjan

3 – 14 Haziran tarihleri arasında, akşam saatlerinde gerekleşecek ve toplam 24 saat sürecek “Linux ve R Uygulamalarıyla RNA-seq Veri Analizi Eğitimi” ile kariyerinizi ileriye taşıyacak kapsamlı ve uygulama odaklı bir biyoinformatik eğitimi sizi bekliyor. Bu eğitim, hem RNA-Seq veri analizinin tüm aşamalarını öğrenmenizi hem de Linux işletim sistemi ve R programlama dili gibi kritik araçları kullanma becerisi kazanmanızı sağlayacak.

Linux ve R Uygulamalarıyla RNA-seq Veri Analizi Eğitimi akademik çalışmalarınıza ve profesyonel kariyerinize değer katacak becerileri kazandırmayı hedeflemektedir. RNA-Seq veri analizinde ve güçlü araçların kullanımında öne çıkarak, iş dünyasında fark yaratın.

Neden Linux?

Linux, biyoinformatik analizlerin gerçekleştirilmesinde kullanılan en yaygın ve güçlü platformlardan biridir. Açık kaynaklı olması, geniş bir araç yelpazesine sahip olması ve yüksek performans sunması, biyoinformatikçiler arasında tercih edilme nedenlerinin başında gelir. Bu eğitimde Linux’u kullanmayı öğrenerek, biyoinformatik analizlerinizi daha verimli ve etkili bir şekilde gerçekleştirebileceksiniz.

Eğitim Hedefleri:

  • R ve bash temel kodlama becerisinin edinilmesi.
  • Dizileme teknolojileri için önemli biyoinformatik araçların öğrenilmesi.
  • RNA-seq veri analizi için iş akışının oluşturulması.
  • Biyoinformatikte kullanılan dosya türlerinin öğrenilmesi.
  • RNA-seq veri analizinin kodlama tabanlı gerçekleştirilmesi.
  • RNA-seq verilerinin manipülasyonu, anlamlandırılması ve görselleştirilmesi.

 

Kimlere Bu Eğitim Tavsiye Edilir

  • Akademisyenler ve Araştırmacılar: Biyoloji, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Genetik, Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Tıp, Veterinerlik, Eczacılık ve Ziraat Fakültelerinde ve yaşam bilimleri alanında çalışan akademisyenler ve araştırmacılar.
  • Sektör Profesyonelleri: Biyoteknoloji, genetik mühendisliği ve ilgili alanlarda çalışan veya çalışmayı planlayan profesyoneller.
  • Uluslararası Standartlarda Proje Üretmek İsteyenler: Çalışmalarını ve yayınlarını uluslararası standartlara uygun hale getirmek isteyen araştırmacılar.
  • Mezunlar: Biyoloji, biyoinformatik, genetik ve moleküler biyoloji gibi yaşam bilimleri alanlarında eğitim almış  olan mezunlar.
  • Lisans ve Lisansüstü Öğrenciler: Biyoinformatik, genetik ve moleküler biyoloji, biyoloji, biyokimya, biyomühendislik, biyoteknoloji, tıp, veterinerlik, eczacılık ve ziraat gibi yaşam bilimleri alanlarında öğrenciler.
  • Veri Bilimciler ve Analistler: Biyoinformatik ve genetik veri analizi alanında uzmanlık kazanmak isteyen veri bilimciler.

Eğitim Gereklilikleri

Bu eğitim temel moleküler biyoloji, genetik ve biyoinformatik kavramları bilenlere tavsiye edilir. Daha önce biyoinformatik dersi almış olanlar için uygundur. Biyoinformatikte Temel Araçlar ve Veritabanları Eğitimi ve Yüksek İşlem Hacimli Veri ve Biyoinformatik Eğitimi alarak bu eğitime hazır hale gelebilirsiniz.

Eğitim Detayları

  • Eğitim Süresi: Toplam 24 Saat (2 hafta)
  • Tarih: 3 – 14 Haziran
  • Zaman: Hafta içi her gün 20:00 – 23:30
  • Kontenjan: 20 kişi ile sınırlı
  • Eğitmen: MSc. Tarık KIRLIOĞLU 

Neden Bu Eğitime Katılmalısınız?

Linux ve R Uygulamalarıyla RNA-seq Veri Analizi Eğitimi size nasıl fayda sağlayacak?

  • Kariyerinizi İleriye Taşıyın:
    • Biyoinformatik alanında Linux ve R gibi sık ve yaygın kullanılan araçları öğrenerek akademik ve profesyonel kariyerinizde fark yaratın.
    • RNA-seq veri analizi ile ilgili tüm aşamaları öğrenerek, bu alanda öne çıkın.
  • Linux ve R Kullanımında Uzmanlaşın:
    • Biyoinformatik analizlerin vazgeçilmez platformu olan Linux’u kullanmayı öğrenin.
    • R programlama dili ile diferansiyel gen ekspresyonu analizi yapma becerisi kazanın.
  • Uygulama Odaklı Eğitim:
    • Canlı ve interaktif derslerle, öğrendiklerinizi hemen uygulama şansı yakalayın.
    • Her adımda eğitici ödevler ve pratik uygulamalar ile bilgilerinizi pekiştirin.
  • Biyoinformatik Araçları Öğrenin:
    • sra-tools, FastQC, Trimmomatic, STAR, featureCounts gibi biyoinformatik araçları kullanmayı öğrenin.
    • RNA-seq veri analizinin tüm adımlarını kapsayan kapsamlı bir eğitim alın.
  • Kısıtlı Kontenjan:
    • Eğitim sadece 20 kişi ile sınırlı olduğundan, bire bir etkileşim ve daha verimli bir öğrenme deneyimi sunar.

Hemen kayıt olarak yerinizi garanti altına alın ve bu fırsatı kaçırmayın.

Eğitim Programı:

1.Gün:RNA-seq Konu Anlatımı

-RNA-seq’e genel bir bakış.

– Linux işletim sisteminin biyoinformatikte yeri.

2.Gün:Windows Altında Linux Alt Sisteminin Kurulması

-Biyoinformatik analizlerin gerçekleştirilmesi için gerekli olan Windows altında Linux alt sistemin kurulması.

-Ubuntu dağıtımının indirilmesi ve kurulması.

– Komut satırı kullanımı ve temel kodlama. Uygulama sonunda eğitici ödev.

3.Gün:Yazılım Yükleme ve Konfigüre Etme

-RNA-seq veri analizi için gerekli olan;

*sra-tools,

*fastQC,

*Trimmomatic,

*STAR,

*featureCounts yazılımlarının yüklenmesi ve konfigüre edilmesi

4.Gün:RNA-seq Veri Analizi – I (Ham veriden (fastq) işlenmiş veriye (counts))

-NCBI veri tabanına genel bir bakış ve kullanımı

-NCBI-GEO kullanımı ve SRA verilerine giriş

-Ensembl veri tabanı kullanımı

-gtf, gff, fasta, fastq, bam, sam dosya formatları

-genom dosyalarının indirilmesi

5.Gün:RNA-seq Veri Analizi – II (Ham veriden (fastq) işlenmiş veriye (counts))

-SRA verilerinin indirilmesi

-SRA verilerinin fastq formatında çıkarılması

-fastq dosyalarının FastQC ile kalite kontrolü

-trimmomatic ile trimleme işlemi

-STAR ile okumaların referans genoma hizalanması

-featureCounts ile sayımların hesaplaması

6.Gün:RNA-seq Veri Analizi – III (Ham veriden (fastq) işlenmiş veriye (counts))

-SRA verilerinin indirilmesi

-SRA okumalarının fastq formatında çıkarılması

-fastq dosyalarının FastQC ile kalite kontrolü

-trimmomatic ile trimleme işlemi

-STAR ile okumaların referans genoma hizalanması

-featureCounts ile sayımların hesaplaması

7.Gün:R Programlama ile Diferansiyel gen ekspresyonu analizi

-R programlama dili kurulumu ve genel bir bakış

-R programlama dilinde temel kodlama becerileri

-R programlama dili kütüphane yükleme

-DESeq2 paketine genel bir bakış

-DESeq2 paketinin yüklenmesi

-DESeq2 paketi ile diferansiyel gen ekspresyonu analizi

8.Gün: Soru, Görüş ve Öneri

 

Başvurunuzu Hemen Yapın ve Yerinizi Garantileyin!

 

Linux ortamında RNA-seq veri analizini öğrenmek ve biyoinformatik dünyasında fark yaratmak için bu benzersiz fırsatı kaçırmayın. Eğitim sonunda, RNA-seq hakkında kapsamlı bir bilgi birikimine sahip olacak ve veri analizlerini baştan sona gerçekleştirebilecek düzeyde olacaksınız.

 

Eğitim Ücreti:

KDV Hariç Tutar: 6.041,67 TL

KDV (%20): 1.208,33 TL

KDV Dahil Toplam Tutar: 7.250,00 TL

Taksitli Ödeme Seçeneği: https://iyzi.link/AJmcbQ

Eğitim Özelliği: Canlı, Çevrim İçi

Kontenjan: 25 kişi ile sınırlıdır.

Bu Eğitimde Ne Öğreneceksiniz?

  • RNA-seq ve Biyoinformatik Temelleri
  • RNA-seq’e Genel Bakış:
  • RNA-seq teknolojisinin temel prensipleri, uygulama alanları ve biyoinformatikteki önemi.
  • Linux İşletim Sistemi:
    • Biyoinformatik analizlerde yaygın olarak kullanılan Linux işletim sisteminin biyoinformatikteki rolü ve avantajları.
    • Linux Ortamının Kurulumu ve Kullanımı
    • Windows Altında Linux Alt Sisteminin Kurulumu:
    • Windows üzerinde Linux alt sistemini (WSL) kurarak, biyoinformatik analizler için uygun bir ortam oluşturma.
    • Ubuntu Kurulumu ve Komut Satırı Kullanımı:
    • Ubuntu dağıtımını indirip kurarak, temel Linux komut satırı ve kodlama becerilerini öğrenme.
  • Biyoinformatik Yazılımlarının Yüklenmesi ve Konfigüre Edilmesi
    • Gerekli Yazılımlar:
    • RNA-seq veri analizi için ihtiyaç duyulan sra-tools, FastQC, Trimmomatic, STAR ve featureCounts gibi yazılımların yüklenmesi ve yapılandırılması.
  • RNA-seq Veri Analizi
    • Veri İndirme ve Format Dönüştürme:
    • NCBI ve Ensembl gibi veri tabanlarından RNA-seq verilerini indirip, bu verileri fastq formatına dönüştürme.
  • Kalite Kontrol ve Veri İşleme:
    • FastQC ile veri kalitesini kontrol etme, Trimmomatic ile düşük kaliteli verileri temizleme ve STAR ile okumaları referans genoma hizalama.
    • Sayım Matrisi Oluşturma:
    • featureCounts yazılımı ile hizalanmış RNA-seq okumalarından sayım matrisi oluşturma.
  • R Programlama ve Diferansiyel Gen Ekspresyonu Analizi
    • R Programlama Dili:
    • R programlama dilinin kurulumu, temel kodlama becerileri ve gerekli kütüphanelerin yüklenmesi.
    • DESeq2 Paketi ile Diferansiyel Gen Ekspresyonu:
    • DESeq2 paketini kullanarak diferansiyel gen ekspresyonu analizi yapma ve sonuçları yorumlama.
  • Soru ve Cevaplar:
    • Eğitim süresince ortaya çıkan soruların yanıtlanması, katılımcıların görüş ve önerilerinin alınması.

 

Eğitim platformu ve erişim şekli:

  • Eğitim online olarak Bioinformy platformu ve Google üzerinde gerçekleşecektir.
  • Kaydınızı tamamladığınızda yetkilimiz sizi Bioinformy platformuna kaydedecek ve bilgilendirme epostası size ulaşacaktır.
  • Eğitim canlı ve online olarak ilerleyecektir.
  • Dersle ilgili tüm duyurular Bioinformy platformundan sağlanacaktır. Ders duyuruları bioinformy.com uzantıllı epostalar ile size iletilecektir.

 

ÖNEMLİ NOTLAR:

  • Taksit imkanı bulunmaktadır.
  • Havale ya da EFT yapmak isteyenler [email protected] adresinden iletişime geçebilirler.
  • Eğitim programı canlı, senkron ve online gerçekleşecektir.
  • Eğitime katılan ve eğitimdeki çalışmaları tamamlayanlara QR kodlu ve doğrulanabilir Certifly tamamlama ve katılım belgeleri verilecektir.
  • Eğitim materyalleri ve videoları eğitimden sonra 1 ay boyunca erişilebilir olacaktır.

Taksit Avantajından Faydalanmak İçin Tıklayınız.

 

Eğitmen: MSc. Tarık KIRLIOĞLU

Tarık KIRLIOĞLU, Bursa Uludağ Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü’nden mezun olmuştur. Yüksek lisans eğitimini Ankara Üniversitesi Biyoloji Bölümü Biyoteknoloji Anabilim Dalı’nda tamamlamıştır. Yüksek lisans eğitimi ile beraber Biyoinformatik üzerine yoğunlaşmıştır. Kırlıoğlu’nun araştırma alanları arasında genomik ve transkriptomik verilerin (WGS, WES, RNA-seq, qRT-PCR) analizi bulunmaktadır.

Akademik kariyeri boyunca, Kırlıoğlu birçok önemli araştırma projesinde yer almış ve özellikle genom-çapında genlerin tanımlanması ve karakterize edilmesi üzerine çalışmıştır. Ayrıca, RNA-seq ve qRT-PCR yöntemleri ile gen ifadesi çalışmalarına katkı sağlamıştır.

Eğitmenlik kariyerinde, Tarık Kırlıoğlu öğrencilere ve araştırmacılara biyoinformatik alanında geniş kapsamlı eğitimler vermektedir. Eğitimleri, katılımcılara biyoloji ve bilgisayar bilimleri arasındaki köprüyü kurmayı ve bu disiplinler arasında etkili iletişimi sağlamayı hedeflemektedir. Katılımcılarına biyoinformatikte temel kavramları öğretirken aynı zamanda bu alandaki güncel gelişmeleri ve ileri düzey yöntemleri de aktarmaktadır.

Tarık Kırlıoğlu, biyoinformatik alanında ileri düzey bilgi ve deneyimiyle öğrencilerin ve araştırmacıların yetişmesine katkı sağlamaktan ve bu alanda başarılı bir kariyere adım atmalarına yardımcı olmaktan büyük bir memnuniyet duymaktadır.

 

Go To Top