• Ders Başlangıç Tarihi

    15 Nisandan itibaren İstediğiniz zaman

  • Format

    Eş zamansız (asenkron) Modül

    PhyML Uygulamalı Filogenetik ve Dizi Hizalama

    Sadece Bir Ağaç Çizmeyin; Evrimi modelleyin

    Evrimsel modeller, ağaç oluşturma yöntemleri ve filogenetik ağaçların yorumlanması gibi konularda bilgi sahibi olacak ve kapsamlı bir PhyML eğitimi alacaklardır.

    Uygulamalar üzerinden öğrenilen beceriler, katılımcıların araştırma ve analiz işlemlerini daha etkili hale getirmelerine olanak tanıyacaktır.

    PhyMLile maksimum olabilirlik (Maximum Likelihood) tabanlı, yayına uygun analizler kurgulayın.
    • Mevcut katılımcılar

      93+

    • Kontenjan:

      Son 57 Kontenjan

      Süre: 

      8 Saatlik video ders,
      Bölüm sonu sınavları, 
      Okumalar

      Write your awesome label here.
      — Yeni dönem

      Verileriniz Hikayesini Yazın

      Biyoinformatikte yapılan en sessiz ama can yakıcı hatalardan biri, filogenetik analizi "kara kutu" bir yazılıma dizileri verip çıkan sonucu kabul etmektir.

      Modern filogenetik, yüksek performanslı algoritmalar  ve gelişmiş istatistiksel modeller gerektirir. Bu eğitimde, filogenetiğin "kara kutusunu" açıyoruz. Yöntemlerin  felsefesini ve iş akışını en temelden öğrenecek; model seçimi ve ağaç doğrulaması süreçlerinde uluslararası standartları yakalayacaksınız.

      Artık ağaçlarınız birer "şema" değil, evrimsel gerçekliğin istatistiksel kanıtı olacak. 

      Bunları biliyor musunuz?

      PhyML: Algoritmanın gücü

       PhyML algoritması, karmaşık evrimsel modelleri kullanarak binlerce sekansı saniyeler içinde analiz edebilen, dünya genelinde en çok atıf alan filogenetik yazılımlardan biridir.
      Ziemann, M., et al. (2016). "Gene name errors are widespread in the scientific literature." Genome Biology, 17:177.

      Model Seçiminin Önemi

      Yanlış ikame modeli seçimi, filogenetik ağaçlardaki topoloji hatalarının %40'ından sorumludur.

      Çalışmaya göre en uygun modelleri seçmek ağaçların doruluğunu artırır. 

      Lisans Özgürlüğü

      Yayınlarda kullandığınız yöntemler makalenizin gücünü belirler.

      Makalelerde Maximum Likelihood yöntemi kullanmak, Bayesyen analizlerle birlikte modern sistematiğin ve moleküler epidemiyolojinin (Örn: Virüs evrimi takibi) tercih ettiği yaklaşımlardandır.

      Kimler için uygun

      Epidemiyologlar, Evrimsel Biyologlar ve Taksonomistler

      Türler arası akrabalık ilişkilerini en yüksek doğrulukla modellemek isteyen araştırmacılar. 

      Patojen evrimini (Virüs/Bakteri) takip etmek ve salgın dinamiklerini analiz etmek isteyen uzmanlar.

      Lisans/Lisans Üstü Öğrenciler

      Kariyer hedefi olan lisans öğrencileri ve mezunlar.

      Tezlerinde "yayınlanabilir kalitede" filogenetik analiz yapmak zorunda olan yüksek lisans ve doktora adayları. 

      Biyoteknoloji, Tıp ve İlaç Sektörü Ar-Ge Uzmanları

      Yeni gen varyantlarını, ilaç direnci gelişimini veya biyo-ürünlerin kökenini/saflığını moleküler düzeyde izlemek ve fikri mülkiyet süreçlerinde kanıta dayalı filogenetik analizleri kullanmak isteyen profesyoneller.

      Ne Kazanacaksınız?

      İleri Düzey Çoklu Dizi Hizalama (MSA) ve Kürasyon:  

      Modern araçlarla, filogenetik sinyali bozan veriyle nasıl başa çıkacağınızı  öğrenerek ağaç doğruluğunuzu artıracaksınız.
      Filogenetik Karar Mekanizmaları: 

      Biyoinformatik dünyasının en prestijli yöntemlerinden biri olan olan ML tabanlı PhyML ile kompleks veri setlerinde bile yüksek çözünürlüklü ağaçlar oluşturacaksınız.
      Uygulamalı Araç Hakimiyeti ve Görselleştirme: 

      Sunucu tabanlı ileri analizler ve büyük veri setlerinin işlenmesi ve köklenmiş (rooted) ve köklenmemiş ağaçlar arasındaki farkı, dış grup (outgroup) seçiminin ağaç yapısını nasıl değiştirdiğini uzman gözüyle değerlendireceksiniz.
      PhyML Pipeline Yönetimi:  

      Çoklu dizi hizalama (Multiple  Sequence Alignment) sürecinden  başlayarak PhyML ile ML ağacı kurma süreçlerini ve bu süreci yönetmeyi öğreneceksiniz.

      Neden Bu Eğitime Katılmalısınız?

      Akademik Standart ve Özgürlük

      Yayın sürecinde en büyük vakit kaybı, metodoloji nedeniyle gelen "Major Revision" kararlarıdır. Bu eğitimde öğrendiğiniz PhyML tabanlı iş akışı, hakemlerin metodolojik güvenini kazanmanızı sağlar. Analizinizi "standardize" edin, reddedilme olasılığını minimize edin.

      Kendi Hızınızda İlerleyin Uygulamaları yapın

      Laboratuvar deneyleriniz veya nöbetleriniz arasında derse yetişme stresi yaşamazsınız. Eğitime kaydolduğunuz an tüm içeriklere erişirsiniz. Videoları durdurabilir, geriye sarabilir ve karmaşık konuları tam kavrayana kadar tekrar izleyebilirsiniz.

      Sertifikasyon

      Eğitimi tamamladığınızda kazandığınız sertifika, sadece bir "katılım" belgesi değildir. Özel ID'li ve doğrulanabilir dijital bağlantısı ile bu sertifika, LinkedIn'de sizi "Filogenetik Analisti" olarak konumlandırır. İş ilanlarında ve proje başvurularında teknik yetkinliğinizi gösterin.

      Eğitim Deneyimi ve Metodoloji

      Dersler eş zamansız (asenkron) kendi hızında öğren programı olarak ilerleyecektir. Derslerdeki sorularınızı eğitmenlerimiz değerlendirecek ve buna göre ilerlemeniz takip edilecektir. 

      Kendi Hızında Adım Adım Öğren

      1 yıl boyunca  erişebileceğiniz videolarla, CV'nizi ve profilinizi adım adım, her akşam bir modülü tamamlayarak güncelleyin.

      Testler ve Sorularla Pekiştir

      Testler ve ödevlerle öğrendiklerinizi uygulayın. 

      Uygulamalarınızı ve sorularınızı Forumda paylaşın eğitmenler ve diğer katılımcılarla sonuçlarınızı tartışın. 

      Etkileşimli Toplulukla Paylaş

      Eres Biotech mezunlar ağında yer alan kıdemli uzmanlarla network kurma ve fırsatlardan ilk haberdar olma ayrıcalığı kazanın. 

      Mentörler, eğitmenler ve mezunların tecrübelerinden faydalanın. 
      Kişiye özel bağlantı ve ID numaralı dijital sertifikalar

      Başarınızı Belgelendirin

      Başarı Sertifikası

      Dersleri ve testleri tamamladığınızda anında sertifikanızı alabilirsiniz.

      Katılım Sertifikası

      Dersleri tamamlayın ve sertifikanızı hemen alın. 

      Kayıt Seçenekleri & Avantajlar:

      Unutmayın: Akademik takviminize göre değil, kendi hızınıza göre uzmanlaşın.
      Hemen kaydolun, dilediğiniz zaman başlayın.

      Öğrenci Planı

      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentörlük oturumları*
      Kaydol
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺4,100
      Kaydol
      Learning programs
      Öğrenci (1 Kurslar)
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺2,583
      Kaydol

      Profesyonel Planı

      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentörlük oturumları*
      Kaydol
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺4,100
      Kaydol
      Learning programs
      Öğrenci (1 Kurslar)
      Ders ücreti
      ₺6,250 ₺2,583
      Kaydol
       Planınızı seçmek için plana ait seçenekten kaydolunuz. 
      * Mentorlük çalışmaları birebir olarak gerçekleştirilecektir. Bunu için eğitmenler ve öğrenciler karşılıklı randevu oluşturacaktır. 

      Sık Sorulan Sorular

      Filogenetik analizler için çok karmaşık kodlama veya bioinformatik altyapısı gerekiyor mu? Hiç bilmeyen biri yapabilir mi?

      Kesinlikle hayır. Bu eğitimin en büyük gücü, karmaşık algoritmaları kullanıcı dostu ama bilimsel gücü yüksek arayüzlerle harmanlamasıdır. Kod yazmanıza gerek kalmadan, profesyonel bir bioinformatikçinin ulaştığı analiz kalitesine nasıl ulaşacağınızı adım adım gösteriyoruz. Temel moleküler biyoloji bilginiz varsa, eğitim sonunda kendi ağaçlarınızı kurgulayabilecek seviyeye geleceksiniz.

      Asenkron eğitimde takıldığım bir yer olursa veya verimle ilgili bir sorun yaşarsam ne olacak?

      Asenkron eğitim, "yalnız başına öğrenmek" demek değildir. Ders içerikleri, sanki yanınızda bir mentor varmışçasına, en çok hata yapılan noktalar vurgulanarak hazırlandı. 

      Sertifikanın akademik veya sektörel mülakatlarda bir ağırlığı var mı?

      Bu sertifika, sizin sadece videoyu izlediğinizi değil; müfredatı başarıyla tamamladığınızı ve PhyML, MSA, Model Seçimi gibi teknik yetkinlikleri kazandığınızı gösterir. LinkedIn profilinize eklediğinizde, dünyanın her yerindeki kurumlar yetkinliğinizi tek tıkla size özel sertifika linkinden doğrulayabilir.

      Eğitim asenkron olduğu için güncelliğini yitirmiş bilgilerle karşılaşır mıyım? Filogenetik yazılımlar sürekli güncelleniyor.

      Eğitim içeriğimiz, filogenetik dünyasının güncel ve kararlı sürümler üzerine kurgulanmıştır. Sizi 10 yıl öncesinin değil, 2026 standartlarının metodolojisiyle donatıyoruz. Yazılımlarda majör bir güncelleme olduğunda, asenkron modüllerimiz bu gelişmelere göre revize edilmektedir.

      Tezimin/Projemin ortasındayım ve çok az vaktim var. Bu eğitim bana zaman mı kazandıracak yoksa üzerime ek bir yük mü bindirecek?

      Deneme-yanılma yoluyla haftalarca sürecek hatalı analiz süreçlerini, size sunduğumuz "adım adım iş akışı" (workflow) sayesinde birkaç saate indirebilirsiniz. Hangi aracın nerede hata verdiğini veya bir ağacın neden "saçmaladığını" çözmekle vakit kaybetmek yerine; en baştan doğru parametrelerle analize başlamayı öğreneceksiniz.

      8. Dönem Toplam Katılımcı İstatistikleri

      Pek çok araştırmacı, öğrenci ve profesyonel aramıza katıldı. Siz de yerinizi ayırtın. 
      Öğrenci kodu: OGRECI
      Çalışan kodu: CALISAN
      Video ders kodu: VIDEO

      Katılımcı

      Sertifika

      Saat
      — Kendi Hızınızda Öğrenin

      Rahat olduğunuz yerden katılın

      Online ve eş zamansız olan bu eğitime istediğiniz zaman, istediğiniz yerden, istediğiniz süre  katılabilirsiniz.

      Video Kayıtlarıyla Ders Kaçırmayın

       Dersleri kaçırma kaygınız olmaz. Ayrıca istediğiniz zaman istediğiniz dersi tekrar izleyebilirsiniz. 

      Ödevler ve Testler

      Eğitim içinde verimliliğinizi arttırmak ve sizi teşvik etmek için ödevler ve testler yer almaktadır. 

      Katılım Sertifikası

      Derslere katılan, test ve ödevleri tamamlayan katılımcılarımıza eğitimin ardından tekil id kodlu ve özel bağlantılı  katılım sertifikaları sağlanmaktadır. 

      Kariyer Mentörlüğü

      Bu ders katılımcıları için, birebir gerçekleştirilen 2 online oturumluk kariyer, yapay zeka kullanımı ve performans mentörlüğü sağlanır. 
      Write your awesome label here.
      Viral varyantların takibinde hızlı ama istatistiksel olarak güvenilir ağaçlar oluşturmamız gerekiyor. Bu kurs sayesind algoritmaları profesyonelce kullanmayı öğrendim. Artık sunduğum raporların bilimsel doğruluğundan %100 eminim. 
      — Merve D., Mikrobiyoloji Uzmanı
      Yüksek impaktlı bir dergiye gönderdiğim makalem, hakemden major revizyon almıştı. Bu eğitimde öğrendiğim PhyML model seçimi tekniklerini uygulayarak analizi tamamen güncelledim. Sonuçta makalem kabul aldı. Keşke makaleyi göndermeden önce bu eğitimi alsaydım, aylarca süren revizyon stresiyle uğraşmazdım.
      — Dr. Yağmur C., Tıp Doktoru
      Master tezimde filogenetik ağaç çizmem gerekiyordu ama tecrübem yokru. 'Default' ayarlarla yaptığım ağaçların neden anlamsız olduğunu bu eğitimle anladım. Asenkron olması sayesinde deneylerimin arasında, takıldığım yerleri tekrar tekrar izleyerek ilerledim. Kesinlikle her kuruşuna değer.
      Sinan K., Biyolog

      Karar Anı: Hangi Ağaç?

      Filogenetik analiz, verinizin milyonlarca yıllık evrimsel hikayesini anlatma sanatıdır. Bu eğitimi tamamladığınızda, sadece "bir yazılımı kullanan" değil, "verisine ve metodolojisine tam hükmeden" bir araştırmacı kimliği kazanacaksınız. Yayınlarınızda seçtiğiniz her evrimsel modelin arkasında matematiksel bir özgüvenle durmanın huzurunu yaşayın.

      Asenkron modelimiz sayesinde eğitim takviminizi laboratuvar yoğunluğunuza göre siz belirlersiniz. Kaydolduğunuz an başlayan bu yolculukta, karmaşık algoritmaların nasıl sadeleştiğine şahit olacaksınız.
      Bu eğitime başlamadan önce filogenetik ağaçlar benim için sadece görsel birer figürdü. Şimdi ise evrimsel modellerin dilini konuşabiliyorum. Bu yetkinlik, sadece yayın kalitemi değil, veriye bakış açımı da değiştirdi. Kendinizi bu akademik derinlikten mahrum bırakmayın.
      ⭐⭐⭐⭐⭐

      Erdal D., Tıp Doktoru

      Tam paket profesyonel kayıt kodu: CALISAN 

      Tam paket öğrenci kayıt kodu: OGRENCI
      Video ders kayıt kodu: VIDEO
      Write your awesome label here.

      Ders Konuları

      "Long-Branch Attraction" Tuzağına Dikkat!

      Filogenetik kurgularda, evrimsel hızı birbirinden bağımsız olarak yüksek olan iki grubun, ağaç üzerinde aslında akraba olmadıkları halde birbirine yakın çıkması durumuna Long-Branch Attraction (LBA) denir. Bu, filogenetik analizin en büyük "yanılsamasıdır".

      Peki, LBA'dan nasıl korunursunuz? Doğru ikame modelini seçmek ve PhyML gibi Maksimum Olabilirlik (ML) tabanlı algoritmalar kullanmak, bu yapay gruplaşmayı önlemenin en güçlü yoludur.
       
      İşte bu bilgi, sizi bir "yazılım kullanıcısı"ndan bir "filogenetikçi"ye dönüştüren farktır.
      Bergsten, Johannes (2005-04-01). "A review of long-branch attraction". Cladistics. 21 (2): 163–193.

      Kariyer Sıçraması İçin Ücretsiz Rehberinizi Alın!

      E-posta listemize katılın, yapay zeka (ATS) sistemlerinden %90+ başarıyla geçen 'ATS Uyumlu Bilimsel CV Hazırlama Rehberi' anında e-postanıza gelsin. Sektörel ipuçlarını ve indirimleri kaçırmayın!
      Thank you!
      *E-posta adresimi bırakarak KVKK Aydınlatma Metni, Gizlilik Politikası ve Çerez Politikası şartlarını okuduğumu ve kabul ettiğimi beyan ederim.
      Write your awesome label here.
      ile oluşturuldu