• Akşam Atölye tarihleri: 

    25 - 26 Şubat 2026
    Akşam

  • Format

    Hibrit- Atölye

     (Canlı Akşam Atölyesi + Projeler)

    Biyoinformatikte GitHub: Tekrarlanabilir Araştırma ve Raporlama

    Bir yıl önce tamamladığınız bir analizi bugün tek bir tıkla, tüm sonuçları ve figürleri dahil ederek yeniden üretebilir misiniz? 
    Modern akademinin en büyük sorunu, analizlerin "dosya_son_v2" karmaşasında kaybolmasıdır. Nature ve Science gibi prestijli dergiler artık sadece sonuçları değil, o sonuçlara giden "yolun" şeffaflığını talep ediyor.

    Bu eğitimde, statik metinlerden dinamik raporlamaya geçiyoruz. Literate Programming araçları ile kodunuzu ve metninizi tek bir çatı altında birleştirirken, Git ve GitHub ile tüm araştırma sürecinizi versiyon kontrolüne almayı öğreneceksiniz.

    Artık revizyon süreçlerinde veya veri değişimlerinde haftalarınızı harcamayacak; yayınlarınızın metodolojisini şeffaf olarak yayınlayabileceksiniz.
    • Mevcut katılımcılar

      129+

    • Kontenjan:

      150

      Süre: 

      6 Saat Yoğun Atölye Seansı

      Write your awesome label here.
      — 2026 Modern Araştırmacı Serisi

      Analizlerde "Zaman Makinesi"

      Git ile bilgisayarınızda yerel bir zaman makinesi oluşturmayı (yazılım) , GitHub ile bu çalışmaları buluttaki profesyonel sosyal ağınıza taşımayı öğreneceksiniz.

      Sadece kod değil; RStudio entegrasyonu ve büyük biyolojik verileri (BAM, FASTQ) depoyu yormadan yönetme stratejilerini ( .gitignore) keşfedeceksiniz.

      Başkasının kodunu bozmadan üzerinde çalışma (Fork) ve ekip projelerinde "çakışmaları" (Conflict) bir profesyonel gibi çözme yetisi kazanacaksınız.
      Araştırmanızı sadece bir makale değil, uluslararası dergilerin talep ettiği standartlarda, hatasız ve denetlenebilir bir dijital mirasa dönüştürün.

      Bunları biliyor musunuz?

      Tekrarlanabilirlik Krizi

      Yapılan bir araştırmaya göre, bilim insanlarının %70'inden fazlası başka bir araştırmacının deneylerini yeniden üretmeyi başaramamış, %50'den fazlası ise kendi deneylerini bile tekrarlayamamıştır.

      Kabul oranları

      Veri setlerini ve kodlarını açık erişimli olarak sunan makalelerin, geleneksel makalelere göre daha fazla atıf aldığı ve daha hızlı kabul edildiği gözlemlenmiştir.

      Zaman Yönetimi

      Tekrarlanabilir raporlama teknikleri, akademik revizyon süreçlerindeki analiz yenileme sürelerini %60'a varan oranlarda kısaltmaktadır.

      Kimler için uygun

      Akademisyenler ve Genç Araştırmacılar

      Proje dökümantasyonunu profesyonelleştirmek ve global çalışmalar yapmak isteyen, ekip içi veri karmaşasını sonlandırmak isteyenler.

      Doktora ve Yüksek Lisans Öğrencileri

      Tez verilerini uluslararası standartlarda raporlamak ve savunma sürecinde metodolojik güven sağlamak isteyenler.

      Kurumsal Araştırmacılar

      Analizlerini interaktif ve yaşayan dökümanlar haline getirmek isteyen profesyoneller.

      Ne Kazanacaksınız?

      Dinamik Raporlama:  
      Literate Programming felsefesiyle analiz çıktılarının tekrarlanabilirliği ve metne entegrasyonu.
      Metodolojik Dökümantasyon:
      Literate Programming felsefesiyle, analizin her adımının neden ve nasıl yapıldığını açıklayan profesyonel dökümantasyon yetisi.
      Versiyon Kontrol Sistemi ve Entegrasyon:
      Git (yerel) ve GitHub (bulut) üzerinde araştırmacı profili oluşturma, depo (Repository) yönetimi, işbirliği teknikleri ve kritik dosyaların kontrol dışı bırakılması için ``` .gitignore ``` kullanımı. Ayrıca, popüler araştırma geliştirme ortamları olan VSCode ve RStudio ile Git/GitHub entegrasyonunu kurma.

      Eğitim Deneyimi ve Metodoloji

      Dersler eş zamansız (asenkron) mentorluk programı olarak ilerleyecektir. Derslerdeki projelerinizi mentörler değerlendirecek ve buna göre ilerlemeniz takip edilecektir. 

      Uygulamalı Akşam Atölyesi: 

      Teorik anlatımın ardından, kendi bilgisayarınızda bir araştırmayı VSCode/RStudio entegrasyonu ile Git/GitHub'a yükleme ve dinamik rapor üretme süreçlerini canlı olarak deneyimliyoruz.

      Dijital Arşiv:

      Eğitimde kullanılan tüm şablonlara ve dökümantasyon rehberlerine ömür boyu erişim imkanı.

      Etkileşimli Topluluk

      Eres Biotech mezunlar ağında yer alan kıdemli uzmanlarla network kurma ve fırsatlardan ilk haberdar olma ayrıcalığı kazanın. 

      Mentörler, eğitmenler ve mezunların tecrübelerinden faydalanın. 
      Kişiye özel bağlantı ve ID numaralı dijital sertifikalar

      Başarınızı Belgelendirin

      Başarı Sertifikası

      Dersleri ve testleri tamamladığınızda anında sertifikanızı alabilirsiniz.

      Katılım Sertifikası

      Dersleri tamamlayın ve sertifikanızı hemen alın. 
      Hedeflerinize odaklanmak için mükemmel bir zaman!

      Kayıt Seçenekleri & Avantajlar:

      Öğrenci Planı

      Kayıt kodu: OGRENCI
      7.500TL
      4.750TL
      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentorluk*

      Profesyonel Planı

      Kayıt kodu: CALISAN
      7.500TL
      6.750TL
      Tam Erişim & Sertifika ve Mezunlar Ağı Erişimi
      • Tam Erişim
      • Katılım/Başarı Sertifikası
      • Mezun ağı ve Mentorluk*

      Video Ders Planı

      Kayıt kodu: VIDEO
      7.500TL
      4.250TL
      Video derslere ve materyallere erişim
      • Videolar ve Ders Materyalleri
      • Sertifika
      • Genel Forum erişimi
       Planınızı seçmek için plana ait kodu ödeme aşamasında indirim kodu alanına yazmanız yeterlidir. 
      * Mentorlük çalışmaları birebir olarak gerçekleştirilecektir. Bunu için eğitmenler ve öğrenciler karşılıklı randevu oluşturacaktır. 

      Sık Sorulan Sorular

      GitHub kullanmak için yazılımcı mı olmak gerekir?

      Hayır. Bu eğitimde GitHub, bir "araştırma dökümantasyon ve işbirliği aracı" olarak araştırmacıların ihtiyacı olan temel komutlarla öğretilmektedir.

      Dinamik Raporlama araçları için sadece belli bir dil (örneğin R) mi bilmek gerekiyor?

      Kullanılan dinamik raporlama araçları (RMarkdown, Jupyter gibi) R'dan gelse de Python, Julia ve SQL gibi birçok dili destekler. Bu eğitimde çok dilli ( ) raporlama mantığı anlatılmaktadır.

      Daha önce hiç terminal/komut satırı kullanmadım, zorlanır mıyım?

      Eğitimimiz "korkutmadan bağlayan" bir metodoloji ile en temelden başlar ve katılımcıyı 6 saatte kendi deposunu yönetecek seviyeye taşır.

      Kodlama bilmiyorum yine de öğrenebilir miyim?

      Kesinlikle. Bu eğitimin odağı "kod yazmak" değil, "araç yönetmektir". Her branştan araştırmacıya uygundur.

      Yayınlarınız beklemesin, tekrarlanabilir süreçlerle hızlanın

      Biyoinformatik dünyasında GitHub profiliniz, diplomanızdan daha yüksek sesle konuşur. Bu kurs size sadece bir araç öğretmiyor; akademik prestijinizi korumanın, iş birliği yapabilmenin ve endüstride yaygın olan standartları yakalamanın anahtarını veriyor.
      Unutmayın: Size özel kayıt kodunuzu ödeme aşamasında kullanabilirsiniz.

      Tam paket profesyonel kayıt kodu: CALISAN 

      Tam paket öğrenci kayıt kodu: OGRENCI
      Video ders kayıt kodu: VIDEO
      Doktora tezim için yazdığım kodların 'analiz_son.R', 'analiz_hoca_duzeltme.R' gibi versiyonlar içinde kaybolması benim için büyük bir stresti. Bilgisayarım çökse bile emeğimin GitHub'da güvende olduğunu bilmek harika. Özellikle VS Code arayüzü ile branch açıp ana projeyi bozmadan denemeler yapabilmek, çalışma hızımı iki katına çıkardı. Ve ayrıca GitHub profilimle akademik dünyada dijital bir portfolyo inşa ediyorum.

      Selin T. - Biyomühendislik Doktora Adayı

      Write your awesome label here.
      Ders Yöneticisi

      Özlem Tuna

      Manisa Celal Bayar Üniversitesi Biyomühendislik lisans ve Ege Üniversitesi Biyomühendislik yüksek lisans mezunu olup, biyoinformatik ve hesaplamalı biyoloji alanlarında akademik altyapıya sahiptir. Çalışmalarında NGS verilerinin analizi, kanser biyoinformatiği ve Python–R tabanlı veri analizi üzerine çalışmıştır. Bunun yanı sıra Nextflow (DSL2) ile ölçeklenebilir, tekrar üretilebilir ve modüler biyoinformatik iş akışları geliştirme konusunda deneyime sahiptir. 
      https://github.com/ozlemtuna 

      Literate Programming - İnsanlar için kodla!

      Literate Programming (Okuryazar Programlama), Donald Knuth tarafından 1984'te ortaya atılan ve kodun bilgisayar için değil, insanlar için yazılması gerektiğini savunan bir felsefedir.

      Literate Programming araçları bu felsefenin günümüzdeki en güçlü temsilcileridir. Bir araştırmada kodun yanına eklediğiniz her bir açıklama satırı, aslında o analizin gelecekteki geçerliliğine atılan bir imzadır.

      Tekrarlanabilirlik, bir tercihten ziyade modern bilimin yeni dürüstlük ölçütüdür.

      Kariyer Sıçraması İçin Ücretsiz Rehberinizi Alın!

      E-posta listemize katılın, yapay zeka (ATS) sistemlerinden %90+ başarıyla geçen 'ATS Uyumlu Bilimsel CV Hazırlama Rehberi' anında e-postanıza gelsin. Sektörel ipuçlarını ve indirimleri kaçırmayın!
      Thank you!
      *E-posta adresimi bırakarak KVKK Aydınlatma Metni, Gizlilik Politikası ve Çerez Politikası şartlarını okuduğumu ve kabul ettiğimi beyan ederim.
      Write your awesome label here.
      ile oluşturuldu